Wbrew pozorom głównym celem oczyszczania wodorowego nie jest oczyszczenie skóry z zaskórników, a działanie przeciwwolnorodnikowe. Redukcja zaskórników oraz martwego naskórka stanowi przyjemny skutek uboczny tego zabiegu.

W trakcie zabiegu wykorzystujemy tzw. aktywny wodór. Wodór jest najmniejszym i najlżejszym pierwiastkiem, dzięki czemu jest on w stanie wniknąć do głębokich warstw skóry i działać już na poziomie komórkowym.

Wolne rodniki lub inaczej reaktywne formy tlenu działają destrukcyjnie względem białek, lipidów oraz kwasów nukleinowych przyspieszając procesy starzenia się skóry. Nadmiar wolnych rodników obserwuje się również w przypadku dermatoz o podłożu zapalnym, bowiem wzmagają one stan zapalny skóry oraz całego organizmu. Wodór neutralizuje reaktywne formy tlenu w wyniku czego powstaje woda oraz czysty tlen.